A legtöbb végbélsipoly műtétet két lépésben, két különböző alkalommal javasolt elvégezni. Ilyenkor első lépésként seton fonalat fűzünk a járatba.

A fistulotomia a sipoly felhasítását jelenti. Ezt a megoldást kizárólag a felszínesen futó sipolyok esetében alkalmazhatjuk.

A LIFT műtét (Ligation of the Intersphincteric Fistula Tract) a sipoly járat lekötését jelenti a végbél záróizom külső és belső gyűrűje közötti térben.

A FiXcision eszköz körvágó késként kivágja az alacsony, mindkét záróizmon átívelő sipoly járatot.

Az eljárás során a sipoly járatot preparációs technikával kiírtjuk, majd a járat belső szájadékát zárjuk és odaforgatott nyálkahártya lebennyel fedjük.

Ez az eljárás kifejezetten azoknak a betegeknek javasolt, akiknek magasra terjedő végbélsipolyuk van.